空间转录组测序


空间转录组测序是在组织原位检测全转录组基因表达的一种技术,可以展示组织切片中不同区域的基因表达情况,同时能够得到目的基因在组织内部的空间位置信息。与传统的全基因转录组或单细胞转录组测序相比,空间转录组测序浆病理影像(H&E染色)与测序数据映射在一起,进而可以分析组织切内部空间结构的细胞异质性。


1.技术优势


① 平台稳定:不需要单细胞解离,组织切片即可;

② 周期短:从样本处理到建库仅需一天;

③ 可视化:Space Ranger可视化数据分析;

④ 空间定位:结合scRNA-seq可实现基因空间定位;

⑤ 兼容性强:人、小鼠、大鼠组织;新鲜冷冻样品和石蜡样本均可;

⑥ 应用领域广:肿瘤异质性、免疫浸润、空间发育图谱构建、神经疾病特征、病理基因表达区域鉴定等;


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